- 烈冰科技專屬分析內(nèi)容
Small RNA是一大類調(diào)控分子,幾乎存在于所有的生物體中,在基因表達調(diào)控、生物個體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過程中起著重要的作用。烈冰科技Small RNA測序分析包括:miRNA、piRNA、tiRNA和tRF。
mi:miRNA(microRNA),是真核生物中廣泛存在的一種長度為21-23nt的RNA分子,可通過與mRNA的結(jié)合,抑制mRNA的轉(zhuǎn)錄,在基因表達調(diào)控、細胞周期、生物體發(fā)育時序等方面起重要作用。
pi:piRNA(Piwi-interactingRNA)是從哺乳動物生殖細胞中分離得到的一類長度約為30nt的小RNA,并且這種小RNA通過與PIWI蛋白家族成員相結(jié)合形成piRNA復(fù)合物(piRC)來調(diào)控基因沉默途徑,與生殖細胞發(fā)育密切相關(guān)。
tiRNA:tiRNA是針對tRNA成熟體加工后的產(chǎn)物,一般分為3ti和5ti,5ti在已知的研究中可以通過置換真核起始因子對于基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯過程產(chǎn)生影響。
tRFs:tRFs是一類tRNA加工后的產(chǎn)物,一般分為tRF-5,tRF-3,tRF-2和tRF-1,四個不同的類型。他們在組織中表達豐度可以非常高。tRF-3以及tRF-5往往和miRNA結(jié)合機制近似,其靶基因降解機制也很類似,并且在已知的研究中發(fā)現(xiàn),其表達與癌癥發(fā)生關(guān)聯(lián)密切是近期重要的研究方向。
烈冰科技提供全套Small RNA測序分析服務(wù),用戶只需提供細胞或組織樣本,由烈冰實驗室完成RNA抽提、文庫構(gòu)建、高通量測序等全部實驗。數(shù)據(jù)交由烈冰專業(yè)生信工程師進行表達鑒定、miRNA預(yù)測、差異篩選、靶基因預(yù)測、ncRNA聯(lián)合分析等各項深入挖掘,并配備技術(shù)支持進行結(jié)果講解,并可提供一系列定制化服務(wù)。
- 三大超強優(yōu)勢
- 實驗流程
- 分析流程
- 烈冰圖例
Nat Commun.2013:2903
miRNA及其靶基因網(wǎng)絡(luò)
Invest Ophthalmol Vis Sci. 2015 Jun;56(6):3673-83.
circRNA-miRNA-mRNA聯(lián)合分析:
Sci Rep. 2016 Mar 2;6:22572
Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11215.
tRF靶向分析:
BMC Biol.2014 Oct 1:12:78
piRNA特異性分析:
Oncotarget. 2016 Jul 13. doi:
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發(fā)表文獻
1. Su X, et al. miRNomes of haematopoietic stem cells and dendritic cells identify miR-30b as a regulator of Notch1. Nat Commun. 2013;4:2903.
2. Xu C, et al. Integrated microRNA-mRNA analyses reveal OPLL specific microRNA regulatory network using high-throughput sequencing. Sci Rep. 2016 Feb 12;6:21580.
3. Fang S, et al. Umbilical Cord-Derived Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomal MicroRNAs Suppress Myofibroblast Differentiation by Inhibiting the Transforming Growth Factor-b/SMAD2 Pathway During Wound Healing. Stem Cells Transl Med. 2016 Jul 7.
4. Zhang C, et al. Primate‐specific miR‐603 is implicated in the risk and pathogenesis of Alzheimer’s disease. Aging (Albany NY). 2016 Feb;8(2):272-90.
5. Nie W, et al. miR-1470 Mediates Lapatinib Induced p27 Upregulation by Targeting c-jun. J Cell Physiol. 2015 Jul;230(7):1630-9.
6. An J, et al. MicroRNA Expression Profile and the Role of miR-204 in Corneal Wound Healing. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2015 Jun;56(6):3673-83.